RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333496.14

CLN3-201, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-201ENST00000333496 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 GPC1P35052 558 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 HPCAL1P37235 193 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MAP3K8P41279 467 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 DIO3P55073 304 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CASP6P55212 293 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 GAB1Q13480 694 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MLC1Q15049 377 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 TMEM198Q66K66 360 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 PAOXQ6QHF9 649 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 8.2
CLN3-201ENST00000333496 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CD163Q86VB7 1156 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 COQ8BQ96D53 544 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 GIMAP5Q96F15 307 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 COL21A1Q96P44 957 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 GNRHR2Q96P88 292 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ADOQ96SZ5 270 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 UBQLN3Q9H347 655 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 C2orf72A6NCS6 295 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 PRRG2O14669 202 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 TPOP07202 933 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 GP1BBP13224 206 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 PRPS1L1P21108 318 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 DRD4P21917 467 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 PNLIPRP2P54317 469 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CLDN8P56748 225 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 C21orf58P58505 322 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 OCRLQ01968 901 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 PACS2Q86VP3 889 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 NUP43Q8NFH3 380 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 RNF138Q8WVD3 245 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MEMO1Q9Y316 297 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 A0A1W2PRB8 838 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 SDHDO14521 159 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 SUSD5O60279 629 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ABCB7O75027 752 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 SNTA1Q13424 505 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CPTPQ5TA50 214 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ATG16L1Q676U5 607 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MAGEB18Q96M61 343 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 EQTNQ9NQ60 294 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CBLCQ9ULV8 474 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-201ENST00000333496 CACNA1CQ13936 2221 aa14.46□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 AQP7O14520 342 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 GNB5O14775 395 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 ANKRD28O15084 1053 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 EMC8O43402 210 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 KITP10721 976 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 LBPP18428 481 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 GDF1P27539 372 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 PTPN6P29350 595 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 IL12BP29460 328 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 MASP1P48740 699 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 PRKAG1P54619 331 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 PSPHP78330 225 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.45□□□□□ -0.1
CLN3-201ENST00000333496 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms