RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MED17Q9NVC6 651 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TOR4AQ9NXH8 423 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TRPM6Q9BX84 2022 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 F3P13726 295 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TRIM23P36406 574 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 STAT5AP42229 794 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SLC1A3P43003 542 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CEBPEQ15744 281 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PYDC2Q56P42 97 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TM9SF2Q99805 663 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A20Q9NP91 592 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CNIH4Q9P003 139 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 OR1A2Q9Y585 309 aa26.25■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 FPR3P25089 353 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PRKAR1BP31321 381 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PTGER1P34995 402 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CDH11P55287 796 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 DAB2P98082 770 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 DSG2Q14126 1118 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ZNF750Q32MQ0 723 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TBRG1Q3YBR2 411 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 FAM78AQ5JUQ0 283 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 NUP43Q8NFH3 380 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 DEPDC7Q96QD5 511 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 KLHL28Q9NXS3 571 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CHST10O43529 356 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CCNYL3P0C7X3 344 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CHRNEQ04844 493 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ACSM1Q08AH1 577 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 DECR1Q16698 335 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 AGBL4Q5VU57 503 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PSD4Q8NDX1 1056 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 BTBD1Q9H0C5 482 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 MMP28Q9H239 520 aa26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TFECO14948 347 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 HCN1O60741 890 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 KRT33BQ14525 404 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 VRK2Q86Y07 508 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CAMKK1Q8N5S9 505 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SYT14Q8NB59 555 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ELP4Q96EB1 424 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 B4DXG7 233 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SURF4O15260 269 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DQB1P01920 261 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 STATHP02808 62 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.792e-8■■■■■ 27.9
UBP1-201ENST00000283628 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 IRF4Q15306 451 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 LCN1P1Q5VSP4 162 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 AADACL4Q5VUY2 407 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C18orf63Q68DL7 685 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ASB16Q96NS5 453 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 MACROD1Q9BQ69 325 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PRR14Q9BWN1 585 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 IL20Q9NYY1 176 aa26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 GSAPA4D1B5 854 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C8orf89P0DMQ9 161 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 MC3RP41968 323 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 MAP4K2Q12851 820 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C16orf62Q7Z3J2 963 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 OR2L3Q8NG85 312 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 OR52E1Q8NGJ3 308 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CHFRQ96EP1 664 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 FRMD6Q96NE9 622 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.22■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CASKO14936 926 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DPB1P04440 258 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CERS1P27544 350 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PDGFRLQ15198 375 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 UAP1L1Q3KQV9 507 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A6Q92536 515 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SOSTQ9BQB4 213 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ACTRT3Q9BYD9 372 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 RNF121Q9H920 327 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.21■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 PROM1O43490 865 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms