RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD3-201ENST00000249440 OBP2AQ9NY56 170 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD3-201ENST00000249440 CNIH4Q9P003 139 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD3-201ENST00000249440 SERGEFQ9UGK8 458 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD3-201ENST00000249440 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD3-201ENST00000249440 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PP55 124 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CEACAM5P06731 702 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 GABRA5P31644 462 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 NR4A2P43354 598 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 RFX2P48378 723 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 SGCGQ13326 291 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 RUNX3Q13761 415 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 FGL2Q14314 439 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 LRRC32Q14392 662 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PIGXQ8TBF5 258 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 DIO2Q92813 273 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ZG16BQ96DA0 208 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PQ09 198 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PS29 197 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 FRS3O43559 492 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CMPK1P30085 196 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PRKAR1BP31321 381 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 OMPP47874 163 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 VITQ6UXI7 678 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 OSTF1Q92882 214 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 GSAPA4D1B5 854 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 DUXAA6NLW8 204 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 AP3D1O14617 1153 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 TMCC2O75069 709 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 AVPR1BP47901 424 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 MAP4K2Q12851 820 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF681Q96N22 645 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 TM9SF2Q99805 663 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 SLC22A4Q9H015 551 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ASGR2P07307 311 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CA3P07451 260 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 LIMS3P0CW19 117 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 LIMS4P0CW20 117 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 STAT5AP42229 794 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CDH11P55287 796 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ASAH1Q13510 395 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 DECR1Q16698 335 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 C11orf74Q86VG3 221 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 IL20Q9NYY1 176 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 SNX7Q9UNH6 387 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PRR19A6NJB7 356 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 FPR3P25089 353 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 RPE65Q16518 533 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXD3-201ENST00000249440 NDUFA5Q16718 116 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms