RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FNTBP49356 437 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 INAVAQ3KP66 663 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 PIK3R3Q92569 461 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 H3BN98 237 aa22.33■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 CTNSO60931 367 aa22.33■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ITIH1P19827 911 aa22.33■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 GRM7Q14831 915 aa22.33■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC38A4Q969I6 547 aa22.33■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF350Q9GZX5 532 aa22.33■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.33■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.33■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 AMZ1Q400G9 498 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 AHSA2Q719I0 299 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC25A45Q8N413 288 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 MUL1Q969V5 352 aa22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPN10Q9HC96 672 aa22.32■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.32■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 ILKQ13418 452 aa22.31■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 DGAT2Q96PD7 388 aa22.31■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.31■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.31■■□□□ 1.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 CNR2P34972 360 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 HSD11B2P80365 405 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ERV3-1Q14264 604 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNAB1Q14722 419 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF836Q6ZNA1 936 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.3■■□□□ 1.16
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