RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hmg20aQ9DC33 346 aa12.81□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Jph1Q9ET80 660 aa12.81□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mamdc4A2AJA7 1228 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r98E9PZ56 857 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nipsnap2O55126 281 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrpap1P55302 360 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ptchd1Q14B62 888 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Coq8bQ566J8 533 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mapk10Q61831 464 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lpcat4Q6NVG1 524 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fblim1Q71FD7 375 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgl1Q71KU9 314 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubfd1Q78JW9 368 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trmt12Q8BG71 446 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lgi4Q8K1S1 537 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Txndc9Q9CQ79 226 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ntn4Q9JI33 628 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbxo8Q9QZN3 319 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhox2dW4VSN9 191 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13040A2A8C4 496 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Esp31A8R0W3 114 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Best1O88870 551 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ArafP04627 604 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ctla2aP12399 137 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H2-T3P14432 384 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Actr1aP61164 376 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Med22Q62276 200 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DmknQ6P253 517 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tas2r104Q7M723 302 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13199Q8C8E0 125 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ZxdcQ8C8V1 858 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gramd1cQ8CI52 457 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GaleQ8R059 347 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Actr1bQ8R5C5 376 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BniplQ99JU7 328 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem179bQ9CY24 219 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spaca1Q9DA48 305 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prl8a1Q9DAV8 240 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ChmlQ9QZD5 621 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17190V9GX38 357 aa12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp599E9PWP1 548 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr287E9PZS7 322 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GlaP51569 419 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taf1aP97357 453 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700066B19RikQ3TS39 127 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ap4e1Q80V94 1122 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acsm4Q80W40 580 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfand1Q8BFR6 268 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gen1Q8BMI4 908 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnk10Q8BUW1 535 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb22Q8BVC1 179 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slitrk6Q8C110 840 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EfhbQ8CDU5 853 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1raQ8CG16 707 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atat1Q8K341 421 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 9030624G23RikQ9D308 155 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phf6Q9D4J7 364 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgf21Q9JJN1 210 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plce1Q8K4S1 2282 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnrc18Q80WC3 2878 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A286YD17 136 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mpeg1A1L314 713 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bcl2a1dO55179 172 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prph2P15499 346 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxc5P32043 222 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr20Q3UWE6 569 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zic2Q62520 530 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifit3Q64345 403 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrp11Q8CB67 483 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nfatc4Q8K120 901 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tvp23bQ9D8T4 205 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cypt12Q9DAR6 119 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Btnl10Q9JK39 275 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Serpini2Q9JK88 405 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dclk1Q9JLM8 756 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc35a2Q9R0M8 390 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HaspinQ9Z0R0 754 aa12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A1L1STL9 112 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spats1A2RRY8 269 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr601A2RS33 314 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp605E9QAH2 694 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5724L7N264 670 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stxbp1O08599 594 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01735 133 aa12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms