RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	NRDC	O43847	1150 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	F13A1	P00488	732 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ADRA2A	P08913	450 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	HRH2	P25021	359 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CASP3	P42574	277 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SCTR	P47872	440 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	GPS1	Q13098	491 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB39A	Q14964	217 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	REP15	Q6BDI9	236 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ELMO1	Q92556	727 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	YIPF5	Q969M3	257 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	FICD	Q9BVA6	458 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	PKP3	Q9Y446	797 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PR80	420 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	HPX	P02790	462 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNA6	P05013	189 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	OR12D1	P0DN82	309 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP11B1	P15538	503 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ENPP1	P22413	925 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL4A	P40617	200 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RAD52	P43351	418 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF165	P49910	485 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXW4	P57775	412 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RELA	Q04206	551 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	MAN2A1	Q16706	1144 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB134	Q4QY38	66 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC23L	Q6PF05	361 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZT83	130 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RAPH1	Q70E73	1250 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM110B	Q8TC76	370 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	UPRT	Q96BW1	309 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIB3	Q96RU7	358 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	GAL3ST1	Q99999	423 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	NDE1	Q9NXR1	346 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	FAT1	Q14517	4588 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	BTBD17	A6NE02	478 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	LDLRAD4	O15165	306 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	GMFG	O60234	142 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	PGM3	O95394	542 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHM	P01871	453 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHA1	P01876	353 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DQB2	P05538	268 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	BPIFB3	P59826	476 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	OGDH	Q02218	1023 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	STK4	Q13043	487 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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