RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF597Q96LX8 424 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNH6Q9H252 994 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SPP1P10451 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF136P52737 540 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LCN8Q6JVE9 175 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM110BQ8TC76 370 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 COG8Q96MW5 612 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NT5DC2Q9H857 520 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 G6PDP11413 515 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNAB2Q13303 367 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MR1Q95460 341 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PSMG2Q969U7 264 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C7orf34Q96L11 122 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 VPS25Q9BRG1 176 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPV4 95 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UNC119BA6NIH7 251 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC31A2O15432 143 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DGKQP52824 942 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PMS2P3Q13401 168 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BRICD5Q6PL45 260 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FIBCD1Q8N539 461 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IL31RAQ8NI17 732 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SEC16AO15027 2179 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AOC2O75106 756 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK5O95279 499 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DTYMKP23919 212 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LIPJQ5W064 366 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF425Q6IV72 752 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF611Q8N823 705 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 THAP4Q8WY91 577 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NICN1Q9BSH3 213 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CD244Q9BZW8 370 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KRBA1A5PL33 1030 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 H7BYZ3 331 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 STBD1O95210 358 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINE2P07093 398 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FXYD6P3P58550 94 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NUS1Q96E22 293 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PMPCAQ10713 525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SHFQ7M4L6 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LRCH3Q96II8 777 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLX4Q8IY92 1834 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF536O15090 1300 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SOCS2O14508 198 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 WNT9AO14904 365 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK2O95069 426 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MMP3P08254 477 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HBQ1P09105 142 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GLO1Q04760 184 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ASRGL1Q7L266 308 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MTURNQ8N3F0 131 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MGLLQ99685 303 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.66□□□□□ -1.34
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