RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	RASSF1	Q9NS23	344 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	DKKL1	Q9UK85	242 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	POLQ	O75417	2590 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PDZD2	O15018	2839 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1B0GTL3	188 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PLOD3	O60568	738 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SBK3	P0C264	359 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	MYL2	P10916	166 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	EPX	P11678	715 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ECHS1	P30084	290 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	NTS	P30990	170 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CPA2	P48052	419 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CCT5	P48643	541 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF136	P52737	540 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	IST1	P53990	364 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SRY	Q05066	204 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	BTK	Q06187	659 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CFAP157	Q5JU67	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	MMP21	Q8N119	569 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	RDH11	Q8TC12	318 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	KAT2A	Q92830	837 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	WNT2B	Q93097	391 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SLC35A4	Q96G79	324 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SFXN2	Q96NB2	322 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM237	Q96Q45	408 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ADO	Q96SZ5	270 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ACPT	Q9BZG2	426 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PIGM	Q9H3S5	423 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	HHATL	Q9HCP6	504 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF225	Q9UK10	706 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	NCKAP5	O14513	1909 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	FAM221A	A4D161	298 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	C2orf72	A6NCS6	295 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	GOLGA8R	I6L899	631 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CASK	O14936	926 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	RIPK2	O43353	540 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	GLRA3	O75311	464 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	FREM3	P0C091	2139 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PYGB	P11216	843 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CD99	P14209	185 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	DDC	P20711	480 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TACR1	P25103	407 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	C2orf80	Q0P641	193 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	NAXE	Q8NCW5	288 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PPCS	Q9HAB8	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	STOML1	Q9UBI4	398 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	HEY2	Q9UBP5	337 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	FBN2	P35556	2912 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	LINC01387	J3KSC0	135 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	RCBTB2	O95199	551 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	DPP4	P27487	766 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41	4e-7	■■■■■ 29.5
GGA3-208	ENST00000579743	WNT3	P56703	355 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	SLC29A2	Q14542	456 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	DECR1	Q16698	335 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC153	Q494R4	210 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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