RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557580.2

TTC8-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 8, humanhuman

TSL 5

Gene TTC8, Length 794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC8-215ENST00000557580 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LINC00523Q86TU6 105 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ANKRD7Q92527 254 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PEX13Q92968 403 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ZNF778Q96MU6 729 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 INPP5KQ9BT40 448 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 AICDAQ9GZX7 198 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 GALPQ9UBC7 116 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 A0A1B0GUS0 222 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PFDN6O15212 129 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PNPP00491 289 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 MSMBP08118 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 NAGAP17050 411 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PTAFRP25105 342 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PTGDSP41222 190 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PLA2G16P53816 162 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PLIN5Q00G26 463 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 CDH17Q12864 832 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ITGADQ13349 1161 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 CCNIQ14094 377 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ACAP2Q15057 778 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 STK11Q15831 433 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 NANPQ8TBE9 248 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 C12orf49Q9H741 205 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SPACA6W5XKT8 324 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LRIT2A6NDA9 550 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 G3V4G9 280 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 GSC2O15499 205 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ADAP00813 363 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 TUBBP07437 444 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 H2AFZP0C0S5 128 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 TNNT1P13805 278 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ABCD3P28288 659 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SLC6A8P48029 635 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 REEP5Q00765 189 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 MAP4K2Q12851 820 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 SP140Q13342 867 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LEG1Q6P5S2 330 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 H2AFVQ71UI9 128 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 PRR22Q8IZ63 422 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 OR51F2Q8NH61 342 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 DOK4Q8TEW6 326 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 NODALQ96S42 347 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 CITED1Q99966 193 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC8-215ENST00000557580 LYRM4Q9HD34 91 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms