RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIME1Q9H400 295 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXorf21Q9HAI6 301 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFDN4Q9NQP4 134 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa17.76■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UQCRHLA0A096LP55 91 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC28A1O00337 649 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AZIN1O14977 448 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGS14O43566 566 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL2RAP01589 272 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HPNP05981 417 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPMP14384 443 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NT5EP21589 574 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNASE1P24855 282 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSTR4P31391 388 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXW4P57775 412 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPP38P78345 283 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTKQ06187 659 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM64Q6YI46 380 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM46Q7Z4K8 759 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PACS2Q86VP3 889 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAXEQ8NCW5 288 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM76AQ8TAV0 307 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPPL2AQ8TCT8 520 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POM121Q96HA1 1249 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANGPTL4Q9BY76 406 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA4P78363 2273 aa17.75■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A6NNC1 897 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPIPB8E9PQR5 432 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEFHP12036 1026 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHN1P15882 459 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK9P50750 372 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRG3P56975 720 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP2R2AP63151 447 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUT7Q11130 342 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UGT3A2Q3SY77 523 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KANK2Q63ZY3 851 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VASNQ6EMK4 673 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POMZP3Q6PJE2 187 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC20BQ86Y33 519 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF615Q8N8J6 731 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UCN3Q969E3 161 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RILPQ96NA2 401 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNRHR2Q96P88 292 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDM14Q9GZV8 571 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBQLN3Q9H347 655 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL27Q9Y4X3 112 aa17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCKAP5O14513 1909 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERPINE1P05121 402 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLK2P20151 261 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF763Q0D2J5 394 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEBPEQ15744 281 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NHSL2Q5HYW2 709 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BICRALQ6AI39 1079 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLEC6AQ6EIG7 209 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALNT18Q6P9A2 607 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf47Q8NEP4 570 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR7G1Q8NGA0 311 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADIPOR1Q96A54 375 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPBAP1Q96EW2 488 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APIPQ96GX9 242 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf27Q9GZN8 174 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10A5Q9H207 317 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBB1Q9H4B7 451 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIRT5Q9NXA8 310 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UTS2RQ9UKP6 389 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFL2Q9Y281 166 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C15orf41Q9Y2V0 281 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FIS1Q9Y3D6 152 aa17.73■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR91A4D1P6 747 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD8B2A6NJW9 211 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITM2AO43736 263 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL3P08700 152 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CASP3P42574 277 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MASP1P48740 699 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNT3P56703 355 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHI3L2Q15782 390 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMKMTQ7Z624 323 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF18BQ86Y91 864 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC26Q8NHZ8 85 aa17.72■□□□□ 0.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf78Q8WTQ4 265 aa17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms