RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP24386 653 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MASP1P48740 699 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MAN2A2P49641 1150 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC23BQ15437 767 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 LTB4RQ15722 352 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MANEAQ5SRI9 462 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL35Q6PF15 583 aa18.96■□□□□ 0.63
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PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC103Q8IW40 242 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC22Q8N4W6 341 aa18.96■□□□□ 0.63
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 CSF3RQ99062 836 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 PINK1Q9BXM7 581 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 UCK2Q9BZX2 261 aa18.96■□□□□ 0.63
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZAR1LA6NP61 321 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM227AF5H4B4 570 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 MPZL2O60487 215 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL10O95999 233 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
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PACSIN3-211ENST00000539589 ACVR2AP27037 513 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 ST13P50502 369 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.96■□□□□ 0.63
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PACSIN3-211ENST00000539589 COL26A1Q96A83 441 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRA2Q9H9E1 313 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 LYRM4Q9HD34 91 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 STARD5Q9NSY2 213 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 GIN1Q9NXP7 522 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-211ENST00000539589 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PRQ8 180 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 DUXAA6NLW8 204 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCA1A8K7I4 914 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 MAN1A2O60476 641 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 OSMP13725 252 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMB9P28065 219 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH4A1P30038 563 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 UGT2B15P54855 530 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1D5P58170 312 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf62Q7Z3J2 963 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 GIMAP5Q96F15 307 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 MS4A4EQ96PG1 132 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SUSD2Q9UGT4 822 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SPACA6W5XKT8 324 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GTQ1 180 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 USP53Q70EK8 1073 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 OR7G2Q8NG99 324 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS15Q8TE58 950 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 FUZQ9BT04 418 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC38A1Q9H2H9 487 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 PATE3B3GLJ2 98 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT5O00445 386 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 EPPINO95925 133 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 AGR2O95994 175 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ALPPP05187 535 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 POU1F1P28069 291 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 STT3AP46977 705 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 CFHR1Q03591 330 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ILKQ13418 452 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-BQ31612 363 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM236Q5W0B7 351 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00471Q8N535 108 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 FCGR1BQ92637 280 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 GGHQ92820 318 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 TGM7Q96PF1 710 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 FKBP14Q9NWM8 211 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 REV1Q9UBZ9 1251 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC88CQ9P219 2028 aa18.93■□□□□ 0.62
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