RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526151.5

PUF60-206, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-206	ENST00000526151	ALOX12B	O75342	701 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	STK17B	O94768	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	EPPIN	O95925	133 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	UMOD	P07911	640 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ALOX5	P09917	674 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SOX11	P35716	441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	KCNJ5	P48544	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PRKAG1	P54619	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CLDN6	P56747	220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PSPH	P78330	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	NSDHL	Q15738	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CDS1	Q92903	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SDF2	Q99470	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151		M0QX08	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SYT5	O00445	386 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SLC30A4	O14863	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	T	O15178	435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	BRINP1	O60477	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	H6PD	O95479	791 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	IFNA14	P01570	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	THBS1	P07996	1170 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CD63	P08962	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SLC5A2	P31639	672 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CFL2	Q9Y281	166 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SUV39H1	O43463	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	SLC28A2	O43868	658 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	TIPRL	O75663	272 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	NR2F1	P10589	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	FAS	P25445	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	AQP1	P29972	269 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PIGA	P37287	484 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	PPIC	P45877	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	DCAF7	P61962	342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	VLDLR	P98155	873 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	OR8K3	Q8NH51	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUF60-206	ENST00000526151	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms