RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524087.5

NPIPB11-201, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 3,653 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-201ENST00000524087 CSF3RQ99062 836 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 LRIT1Q9P2V4 623 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF639Q9UID6 485 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 C3orf18Q9UK00 162 aa7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 LRIT2A6NDA9 550 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 URADA6NGE7 173 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 P2RX6O15547 441 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 IFNA14P01570 189 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GKN3PP0CG01 181 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ALOX12P18054 663 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SERHLQ9NQF3 203 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 BATF3Q9NR55 127 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SMIM30A4D0T7 59 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GFRA3O60609 400 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 NTN1O95631 604 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 C8BP07358 591 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 DDCP20711 480 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 CAPGP40121 348 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 MAP4K2Q12851 820 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 FAM53BQ14153 422 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 CARM1Q86X55 608 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 FANCEQ9HB96 536 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ADAM10O14672 748 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 CPMP14384 443 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ITPKBP27987 946 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 EPHA2P29317 976 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GABRA3P34903 492 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 MASP1P48740 699 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PRR5P85299 388 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 MYBPC1Q00872 1141 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 DUSP7Q16829 419 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 STX19Q8N4C7 294 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 DPP10Q8N608 796 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 OR2L5Q8NG80 312 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GIPC3Q8TF64 312 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 TCTN2Q96GX1 697 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ZNF607Q96SK3 696 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 FEVQ99581 238 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 RNF32Q9H0A6 362 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 FAM60AQ9NP50 221 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 VNN3Q9NY84 501 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ATRXP46100 2492 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 USP34Q70CQ2 3546 aa6.99□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 H0YIG0 161 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 H3BSH0 61 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 HCRTR1O43613 425 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 PRMT3O60678 531 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SERPINB7O75635 380 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 UGT2B17O75795 530 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 ANGPTL1O95841 491 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 GSTT1P30711 240 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SOX18P35713 384 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 DCTP40126 519 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 WNT3P56703 355 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.98□□□□□ -1.29
NPIPB11-201ENST00000524087 TMEM205Q6UW68 189 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms