RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF544Q6NX49 715 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 GLYATL1Q969I3 302 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 FAF2Q96CS3 445 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CAPNS2Q96L46 248 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ADPGKQ9BRR6 497 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 DNAJC11Q9NVH1 559 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 MSH6P52701 1360 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 JCADQ9P266 1359 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PXDNQ92626 1479 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ADGRB2O60241 1585 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.94□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PTCH1Q13635 1447 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 SETD5Q9C0A6 1442 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CHD4Q14839 1912 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 MYOM2P54296 1465 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 METP08581 1390 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 KANK1Q14678 1352 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PNPLA6Q8IY17 1366 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 APBB3O95704 486 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 OAS1P00973 400 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV3-9P01782 118 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 TSPY4P0CV99 314 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 TSPY10P0CW01 314 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PVRP15151 417 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ACADSBP45954 432 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 SMSP52788 366 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CD47Q08722 323 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 SERTAD2Q14140 314 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 STXBP2Q15833 593 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 IFI44LQ53G44 452 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 TAF3Q5VWG9 929 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 LINC00696Q6ZRV3 163 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ASRGL1Q7L266 308 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD9Q7L273 389 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 UNC5CLQ8IV45 518 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 STHQ8IWL8 128 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 OR2L5Q8NG80 312 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 C19orf43Q9BQ61 176 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM9Q9C026 710 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 DCLRE1BQ9H816 532 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CNIH4Q9P003 139 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 EMCNQ9ULC0 261 aa2.93□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ROCK1Q13464 1354 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PIK3R4Q99570 1358 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 EPOPA6NHQ4 379 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ZFP92A6NM28 416 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 SH2D1BO14796 132 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 REC8O95072 547 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ELK1P19419 428 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 IL2RGP31785 369 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CTNNB1P35222 781 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 P2RY4P51582 365 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RIPK4P57078 832 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 HERV-K104P63124 156 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 TYSND1Q2T9J0 566 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ARMC3Q5W041 872 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RAPH1Q70E73 1250 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 GPR142Q7Z601 462 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 LINC01006Q8NI28 216 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 RDH11Q8TC12 318 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 GPR174Q9BXC1 333 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 GANQ9H2C0 597 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 NRN1Q9NPD7 142 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ESM1Q9NQ30 184 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL21Q9UJP4 597 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 CASZ1Q86V15 1759 aa2.92□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf167Q5SNV9 1468 aa2.91□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PEAK1Q9H792 1746 aa2.91□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC37A3O60309 1634 aa2.91□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0A6YYD4 124 aa2.91□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0U1RQK1 487 aa2.91□□□□□ -1.94
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF320A2RRD8 509 aa2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms