RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 HMGA2P52926 109 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 IST1P53990 364 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PSG6Q00889 435 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 MC2RQ01718 297 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CHRNEQ04844 493 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 GPAT3Q53EU6 434 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 COMTD1Q86VU5 262 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SLC9A6Q92581 669 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TSLPQ969D9 159 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 FKBP10Q96AY3 582 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 FBXL20Q96IG2 436 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 LRFN5Q96NI6 719 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PSD2Q9BQI7 771 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 Q9H521 79 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.93□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CACNA1HO95180 2353 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OR2W5A6NFC9 320 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 EFCAB7A8K855 629 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 HRKO00198 91 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 GNGT2O14610 69 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 IFNW1P05000 195 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 THBS1P07996 1170 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 RHCEP18577 417 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SSTR4P31391 388 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TCF15Q12870 199 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 DCST2Q5T1A1 773 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 C1orf189Q5VU69 101 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 MLIPQ5VWP3 458 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CARM1Q86X55 608 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TFAP2CQ92754 450 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PROX1Q92786 737 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PIP5K1AQ99755 562 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ARHGDIGQ99819 225 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 EDEM2Q9BV94 578 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 REEP1Q9H902 201 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 APMAPQ9HDC9 416 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CTSFQ9UBX1 484 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.92□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 AGAP5A6NIR3 686 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 BRINP1O60477 761 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 FCMRO60667 390 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SEMA7AO75326 666 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 DDAH2O95865 285 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ALBP02768 609 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ALPPP05187 535 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OR1E2P47887 323 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 HPCAP84074 193 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 MED21Q13503 144 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CSRP2Q16527 193 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 VWA2Q5GFL6 755 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 FAHD1Q6P587 224 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 STK32CQ86UX6 486 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 COX18Q8N8Q8 333 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 DOK4Q8TEW6 326 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ADI1Q9BV57 179 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OR10A5Q9H207 317 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PRODH2Q9UF12 536 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 IFT52Q9Y366 437 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms