RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 E9PMD0 336 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SGK494L7N484 410 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RASGRF2O14827 1237 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CT45A10P0DMU9 189 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ETS1P14921 441 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPN6P29350 595 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRDX6P30041 224 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRDX2P32119 198 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAGEA9P43362 315 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASMTP46597 345 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAG2P55895 527 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SRYQ05066 204 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC10A1Q14973 349 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 NAXDQ8IW45 347 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRAPQ8TCY5 172 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CARD6Q9BX69 1037 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRODH2Q9UF12 536 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 H3BTX0 84 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADAM12O43184 909 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGKV3-15P01624 115 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PGAM2P15259 253 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYP11B1P15538 503 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 GAP43P17677 238 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPN4P29074 926 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 HSPA1LP34931 641 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RFC2P35250 354 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC25A1P53007 311 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC26A5P58743 744 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PAX2Q02962 417 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZP4Q12836 540 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CNSTQ6PJW8 725 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM26Q6ZUK4 368 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RFESDQ8TAC1 157 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 GTSF1Q8WW33 167 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SAMD8Q96LT4 415 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNK16Q96T55 309 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUDCQ9Y266 331 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRIN2DO15399 1336 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 LGALS8O00214 317 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SDC3O75056 442 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 LAMP1P11279 417 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOVP48745 357 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRT71Q3SY84 523 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PARP10Q53GL7 1025 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 LGSNQ5TDP6 509 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CD177Q8N6Q3 437 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 SERAC1Q96JX3 654 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAB17Q9H0T7 212 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 C1orf21Q9H246 121 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 GHRLQ9UBU3 117 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 VSIG4Q9Y279 399 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 TTC26A0AVF1 554 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRT87PA6NCN2 255 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-334P-201ENST00000517072 A8MX80 341 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms