RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517003.1

RN7SKP2-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP2, Length 319 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP2-201ENST00000517003 DCST1Q5T197 706 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CMIPQ8IY22 773 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TAGAPQ8N103 731 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 D2HGDHQ8N465 521 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SVOPQ8N4V2 548 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SMYD1Q8NB12 490 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 MORN4Q8NDC4 146 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC38A3Q99624 504 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 MAP3K3Q99759 626 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.3□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CLCA1A8K7I4 914 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 H3BSA7 217 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 DUX1O43812 170 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 UGT2B17O75795 530 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR6B1O95007 311 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CBX7O95931 251 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 IGF2P01344 180 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ALOX5P09917 674 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ACP2P11117 423 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 GNSP15586 552 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC5A2P31639 672 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RORAP35398 523 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ADH7P40394 386 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC15A1P46059 708 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 STT3AP46977 705 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 GSSP48637 474 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CRISP1P54107 249 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CDH15P55291 814 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 CDC42P60953 191 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PPP1CAP62136 330 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PMS2P3Q13401 168 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RAB39AQ14964 217 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TRAM2Q15035 370 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OCLNQ16625 522 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 DUSP5Q16690 384 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 PMS2CLQ68D20 193 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 C12orf73Q69YU5 71 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC25A45Q8N413 288 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 APH1BQ8WW43 257 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 FGF11Q92914 225 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC38A4Q969I6 547 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.29□□□□□ -1.24
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms