RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SNED1Q8TER0 1413 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 FANCIQ9NVI1 1328 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 AKAP11Q9UKA4 1901 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 A8MVM7 634 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NPIPA5E9PKD4 350 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 P2RX6O15547 441 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TPST2O60704 377 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CTAG2O75638 210 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 IL1BP01584 269 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 HMBSP08397 361 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ACP2P11117 423 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MYOGP15173 224 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF1BP20333 461 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MX1P20591 662 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NT5EP21589 574 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GLRA1P23415 457 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CTNNA2P26232 953 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 DUTP33316 252 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CA8P35219 290 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 HSD17B2P37059 387 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 DPTQ07507 201 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 IL18Q14116 193 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TRIP10Q15642 601 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC57Q2TAC2 916 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GPR33Q49SQ1 333 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 AADACL4Q5VUY2 407 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CST9Q5W186 159 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TTC23Q5W5X9 447 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RTL6Q6ICC9 239 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GPR142Q7Z601 462 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CUZD1Q86UP6 607 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 DCLK2Q8N568 766 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 OR4C15Q8NGM1 316 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 OR13C5Q8NGS8 318 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MYLPFQ96A32 169 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NSL1Q96IY1 281 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ARL5BQ96KC2 179 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 C4orf36Q96KX1 117 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 UHRF2Q96PU4 802 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 KRT12Q99456 494 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RIOX1Q9H6W3 641 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 POT1Q9NUX5 634 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GALPQ9UBC7 116 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MIOXQ9UGB7 285 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CA5BQ9Y2D0 317 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ETV7Q9Y603 341 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GMEB1Q9Y692 573 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CACNA1FO60840 1977 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa2□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 A0A075B6Q4 140 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA8OA6NCC3 632 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 OR52A4PA6NMU1 304 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 WASHC1A8K0Z3 465 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MEI4A8MW99 385 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 INAFM1C9JVW0 142 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF587BE7ETH6 402 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA8NF8WBI6 632 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 KLF11O14901 512 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 STX7O15400 261 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ATP1B1P05026 303 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 IVLP07476 585 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 PAICSP22234 425 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 AADACP22760 399 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RFC2P35250 354 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NPY2RP49146 381 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 PGFP49763 221 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RGS4P49798 205 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 BLVRAP53004 296 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ABATP80404 500 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 PLD1Q13393 1074 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NFATC4Q14934 902 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 PRTGQ2VWP7 1150 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 KCTD21Q4G0X4 260 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CYBRD1Q53TN4 286 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 LDLRAP1Q5SW96 308 aa1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms