RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 ACOX3O15254 700 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 E2F6O75461 281 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 AK1P00568 194 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ITGA2P17301 1181 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN7P41732 249 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ5P48544 419 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PLPP5Q8NEB5 264 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 OR7G1Q8NGA0 311 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 SDCCAG3Q96C92 435 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 OR10A5Q9H207 317 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 A8MUA0 341 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 H0YJX3 145 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 DIRAS1O95057 198 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 NKX2-2O95096 273 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ACADSP16219 412 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 AGXTP21549 392 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 EFNA3P52797 238 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 KCNC4Q03721 635 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 DCST2Q5T1A1 773 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 WLSQ5T9L3 541 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 SVOPLQ8N434 492 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PIK3R3Q92569 461 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FBXL20Q96IG2 436 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 SDF2Q99470 211 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 THSD1Q9NS62 852 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 DSPPQ9NZW4 1301 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 WDR45Q9Y484 360 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 G3V2T6 193 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 RASAL1O95294 804 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ALPPP05187 535 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 HSPA13P48723 471 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 IQCCQ4KMZ1 466 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 VSTM2LQ96N03 204 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 BTBD9Q96Q07 612 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF347Q96SE7 839 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FCMRO60667 390 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 IFNW1P05000 195 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6V1C1P21283 382 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 IST1P53990 364 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PRODH2Q9UF12 536 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 MKLN1Q9UL63 735 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 STX11O75558 287 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 HEXBP07686 556 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PSG6Q00889 435 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 CCNJQ5T5M9 372 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FRRS1Q6ZNA5 592 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 STK32CQ86UX6 486 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ULBP3Q9BZM4 244 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 LOXL2Q9Y4K0 774 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 U3KQV3 271 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 EI24O14681 340 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 DPM1O60762 260 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF28P17035 718 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 TGM1P22735 817 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 NBL1P41271 181 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ISXQ2M1V0 245 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 OR5K1Q8NHB7 308 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 OR14A16Q8NHC5 309 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FKBP10Q96AY3 582 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF597Q96LX8 424 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 OR8D2Q9GZM6 311 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 REEP1Q9H902 201 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PRAMEF25A6NGN4 478 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 TTC36A6NLP5 189 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 IDSB3KWA1 339 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 ALBP02768 609 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-210ENST00000489475 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms