RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 KAT2AQ92830 837 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC35A4Q96G79 324 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ADOQ96SZ5 270 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ACPTQ9BZG2 426 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 GALNT8Q9NY28 637 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MCM8Q9UJA3 840 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 EDARQ9UNE0 448 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.37■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 C17orf51A8MQB3 221 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 REM1O75628 298 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SUPT7LO94864 414 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RAF1P04049 648 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CT45A8P0DMV1 189 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CT45A9P0DMV2 189 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 HSD3B1P14060 373 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 HSD3B2P26439 372 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 STARP49675 285 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 LHX2P50458 406 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAM8P78325 824 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RASA2Q15283 850 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 POU4F3Q15319 338 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PLCZ1Q86YW0 608 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TMCO6Q96DC7 493 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 VSTM2LQ96N03 204 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF382Q96SR6 550 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DLL4Q9NR61 685 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.36■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPAN2O60636 221 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RCBTB2O95199 551 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT6AP02538 564 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT6BP04259 564 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CTAGE8P0CG41 777 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 GCAP28676 217 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SRD5A2P31213 254 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CPA2P48052 419 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT6CP48668 564 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 APIPQ96GX9 242 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SFXN2Q96NB2 322 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 UCN2Q96RP3 112 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TM9SF2Q99805 663 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 EBPLQ9BY08 206 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM216Q9P0N5 145 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DKKL1Q9UK85 242 aa15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PPR1 153 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PLOD2O00469 737 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DLX3O60479 287 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCB7O75027 752 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 HRGP04196 525 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DRD2P14416 443 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TAC1P20366 129 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 GRK2P25098 689 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 IL12BP29460 328 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 HMOX2P30519 316 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CLDN18P56856 261 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 KEAP1Q14145 624 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 AAGABQ6PD74 315 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 OR7G2Q8NG99 324 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 METTL6Q8TCB7 284 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF138Q8WVD3 245 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 WNT2BQ93097 391 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 ERP27Q96DN0 273 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.34■□□□□ 0.05
SKIV2L-211ENST00000485349 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms