RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	INPP5K	Q9BT40	448 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CBLC	Q9ULV8	474 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SUV39H1	O43463	412 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PPM1B	O75688	479 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	C1QL1	O75973	258 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KCNH1	O95259	989 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ACP2	P11117	423 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NAGA	P17050	411 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MATN1	P21941	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CDKN2C	P42773	168 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GPR85	P60893	370 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	RCAN2	Q14206	197 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NTRK2	Q16620	822 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DECR1	Q16698	335 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CDC73	Q6P1J9	531 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019		G3V3Y1	287 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PEX1	O43933	1283 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NME2P1	O60361	137 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NKX2-2	O95096	273 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CCL3	P10147	92 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CAPN3	P20807	821 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CNR1	P21554	472 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NME2	P22392	152 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MLLT10	P55197	1068 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CASP9	P55211	416 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	INA	Q16352	499 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DUSP5	Q16690	384 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	COX18	Q8N8Q8	333 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DIO2	Q92813	273 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CDS1	Q92903	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	COL21A1	Q96P44	957 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	STAC	Q99469	402 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PIGU	Q9H490	435 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PP18	115 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ANGPT2	O15123	496 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SLC28A2	O43868	658 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	HS6ST1	O60243	411 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SNX3	O60493	162 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TSPAN2	O60636	221 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC22	O60826	627 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ABCB7	O75027	752 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	UGT2B11	O75310	529 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SOX30	O94993	753 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PIGA	P37287	484 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TRPC1	P48995	793 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MEOX1	P50221	254 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.72	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms