RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SERPINA3P01011 423 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ESR1P03372 595 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TCRBP04435 133 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SERPINA5P05154 406 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 THP07101 528 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SBK2P0C263 348 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 UBBP0CG47 229 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PRG2P13727 222 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ENGP17813 658 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PRKACGP22612 351 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 AHCYP23526 432 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PTAFRP25105 342 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PTPN3P26045 913 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MNDAP41218 407 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ACTR1BP42025 376 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 EFNA5P52803 228 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GMFBP60983 142 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 UFM1P61960 85 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RAC1P63000 192 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CXADRP78310 365 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PITPNAQ00169 270 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ACSM1Q08AH1 577 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CSHL1Q14406 222 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GPR176Q14439 515 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MED22Q15528 200 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SSX2Q16385 188 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SGCAQ16586 387 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FAM187BQ17R55 369 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ZNF699Q32M78 642 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SYTL3Q4VX76 610 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZNB5 142 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CBLL1Q75N03 491 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SSX9Q7RTT3 188 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 OR6V1Q8N148 313 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FTMTQ8N4E7 242 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ZNF561Q8N587 486 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GPR156Q8NFN8 814 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 OR1S1Q8NH92 325 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FATE1Q969F0 183 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ZNF382Q96SR6 550 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 IFT27Q9BW83 186 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NLNQ9BYT8 704 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GLOD4Q9HC38 313 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NANSQ9NR45 359 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TREX1Q9NSU2 369 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CLDND1Q9NY35 253 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 VNN3Q9NY84 501 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GUH1 482 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TMEM129A0AVI4 362 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 POM121BA6NF01 834 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ISM1B1AKI9 464 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CTDSPLO15194 276 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SEPT4O43236 478 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 HPGDSO60760 199 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF2O60811 474 aa6.75□□□□□ -1.33
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