RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SMPDL3BQ92485 455 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C14orf79Q96F83 325 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SFXN2Q96NB2 322 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 COL21A1Q96P44 957 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EQTNQ9NQ60 294 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TACC2O95359 2948 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NF1P21359 2839 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SPG11Q96JI7 2443 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FRG2CA6NGY1 282 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ACOX3O15254 700 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CDH16O75309 829 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EPPINO95925 133 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HPNP05981 417 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CPA3P15088 417 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DRD5P21918 477 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN6P29350 595 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MC3RP41968 323 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CCT5P48643 541 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EMDP50402 254 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRKAG1P54619 331 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DLX5P56178 289 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF7P61962 342 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HSPB3Q12988 150 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GALNTL6Q49A17 601 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 VASNQ6EMK4 673 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ENPP6Q6UWR7 440 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GALNT10Q86SR1 603 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LUZP2Q86TE4 346 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LCA5Q86VQ0 697 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 IFNEQ86WN2 208 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LACC1Q8IV20 430 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NAXEQ8NCW5 288 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OR7G2Q8NG99 324 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01560Q8TB33 94 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO30Q8TB52 745 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 AGR3Q8TD06 166 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB9Q96C00 473 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC126Q96EE4 140 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF681Q96N22 645 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf51A8MQB3 221 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 G3V2L1 256 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SNPHO15079 494 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SEC14L5O43304 696 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DIAPH2O60879 1101 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CBR3O75828 277 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CHEK2O96017 543 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ACTL6AO96019 429 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PROCP04070 461 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00032P0C843 101 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NAGAP17050 411 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KRT4P19013 534 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DDCP20711 480 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GRK2P25098 689 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TACR1P25103 407 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DPP4P27487 766 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CPOXP36551 454 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ASCL1P50553 236 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EFR3AQ14156 821 aa7.35□□□□□ -1.23
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