RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 THBS1P07996 1170 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 GUSBP08236 651 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ALOX5P09917 674 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFV2P19404 249 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ALDH4A1P30038 563 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ACTR1BP42025 376 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 RABIFP47224 123 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TPMTP51580 245 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CCR5P51681 352 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SMSP52788 366 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PRKAG1P54619 331 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ACTR1AP61163 376 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZXDAP98168 799 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ST3GAL3Q11203 375 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TSPAN31Q12999 210 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 INAQ16352 499 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 DECR1Q16698 335 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KCT2Q8NC54 265 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SLC6A18Q96N87 628 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SATB2Q9UPW6 733 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KCNE3Q9Y6H6 103 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OR5K4A6NMS3 321 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 B3GALT2O43825 422 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OR5F1O95221 314 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CPN2P22792 545 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 GRK5P34947 590 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 GIPRP48546 466 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF91Q05481 1191 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PRKCDQ05655 676 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ITGADQ13349 1161 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 FHL5Q5TD97 284 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CLDN22Q8N7P3 220 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OPALINQ96PE5 141 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 IL21RQ9HBE5 538 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CHST2Q9Y4C5 530 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 H3BN98 237 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 M0R129 80 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 DSCR3O14972 297 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CYP7B1O75881 506 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 POU1F1P28069 291 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 IFNA8P32881 189 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 IQCHQ86VS3 1027 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SLC35A4Q96G79 324 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MYO10Q9HD67 2058 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf74A8MZ97 194 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 STATHP02808 62 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ATP1B1P05026 303 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ACSL1P33121 698 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 NUDT1P36639 197 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF45Q02386 682 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CHRNEQ04844 493 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OR7G2Q8NG99 324 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CFL2Q9Y281 166 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 A0A075B6Q4 140 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WUU8 490 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0G2JNG1 304 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PS29 197 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 AGAP5A6NIR3 686 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SNTNA6NMZ2 147 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 P2RX6O15547 441 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms