RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 Q8NBF4 154 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PRSS33Q8NF86 280 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 BEST4Q8NFU0 473 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.88e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-207ENST00000470201 UPRTQ96BW1 309 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CASD1Q96PB1 797 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM173AQ9BQD7 235 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA2Q9UM82 520 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 AUP1Q9Y679 476 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIAL4DF5H284 164 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 K7EQM0 130 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 K7ERI5 159 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SOCS3O14543 225 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CTAGE5O15320 804 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 UFL1O94874 794 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 IQCF3P0C7M6 154 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP6V1C1P21283 382 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 GLRA2P23416 452 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R1BP30154 601 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CA8P35219 290 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC1A4P43007 532 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP12AP54707 1039 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HAND2P61296 217 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 NUCB2P80303 420 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SPIBQ01892 262 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CHIT1Q13231 466 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CCL14Q16627 93 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TATDN3Q17R31 274 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 C2CD6Q53TS8 623 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PNCKQ6P2M8 343 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 Q7L0L9 218 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 RPAINQ86UA6 219 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OR52J3Q8NH60 311 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OSTF1Q92882 214 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC45A3Q96JT2 553 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC25Q96NG3 672 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF607Q96SK3 696 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ATF6BQ99941 703 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 KDRP35968 1356 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SALL1Q9NSC2 1324 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 GSAPA4D1B5 854 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ASB14A6NK59 587 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC01565O15544 149 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 RIPK2O43353 540 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZG16O60844 167 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT14O95848 222 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV3-20P01619 116 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB7P09629 217 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HSD17B1P14061 328 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PAX7P23759 505 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRP35270 261 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP4BP51164 291 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 IL24Q13007 206 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR5LQ6MZQ0 368 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF613Q6PF04 617 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 APOOLQ6UXV4 268 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CATSPER3Q86XQ3 398 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms