RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529		M0QX08	132 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	HRK	O00198	91 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	T	O15178	435 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DPM1	O60762	260 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINB7	O75635	380 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPNS1	P04632	268 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	UMOD	P07911	640 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CT45A8	P0DMV1	189 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CT45A9	P0DMV2	189 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NR2F1	P10589	423 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ACP2	P11117	423 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NCK1	P16333	377 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SSTR4	P31391	388 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PTGER1	P34995	402 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYBA2	P53672	197 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FUT5	Q11128	374 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	RTP5	Q14D33	572 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP5	Q16690	384 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PYURF	Q96I23	114 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	LPAR4	Q99677	370 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.84	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.83	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529		A8MVJ9	347 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	AGRP	O00253	132 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	MFN2	O95140	757 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA1	P01009	418 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	RAP2A	P10114	183 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	TCN2	P20062	427 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	STAT5A	P42229	794 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEA2	P43356	314 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	CASP9	P55211	416 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	SYPL1	Q16563	259 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TRAF4-208	ENST00000469529	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.83	□□□□□ -0.52

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