RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PROM1O43490 865 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM1AO60341 852 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3BGRLO75368 114 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DRD3P35462 400 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CRATP43155 626 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR3A3P47888 321 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKGP49619 791 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXK2Q01167 660 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DMWDQ09019 674 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PLD1Q13393 1074 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH18Q13634 790 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GINS1Q14691 196 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51Q1Q8NH59 317 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK6Q92876 244 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAPC3Q92966 411 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NXPE3Q969Y0 559 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM245Q9H330 911 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IL21RQ9HBE5 538 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PR48 441 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PGRMC2O15173 223 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ASNA1O43681 348 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CATP04040 527 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CSF2P04141 144 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHX1P07099 455 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCRC2P22695 453 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MYL9P24844 172 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GNG2P59768 71 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DSTNP60981 165 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4F8P98187 520 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN31Q12999 210 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FGL2Q14314 439 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BHMTQ93088 406 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRC1Q96M27 445 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UBQLN3Q9H347 655 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C4K7 107 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK2AP1O14519 115 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LDB3O75112 727 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ELK1P19419 428 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 VIPR1P32241 457 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RAG2P55895 527 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1G2P78368 415 aa3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 C22orf42Q6IC83 251 aa3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 CMIPQ8IY22 773 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX19Q8NA77 164 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SGK2Q9HBY8 427 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR34Q9UPC5 381 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SURF4O15260 269 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GRM6O15303 877 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB5O43674 189 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A4O95047 310 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD34CP0C6C1 535 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56A5P0C7T3 313 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ATF1P18846 271 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 AVPR1BP47901 424 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARPP19P56211 112 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 MGAT2Q10469 447 aa3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 MED22Q15528 200 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CNIH2Q6PI25 160 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF687Q8N1G0 1237 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM80Q96HE8 168 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A7Q96R45 310 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 F2RL3Q96RI0 385 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG5Q9Y673 324 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1HO95180 2353 aa3.39□□□□□ -1.87
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