RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ACADMP11310 421 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 EFNB1P98172 346 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXC5Q00444 222 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FUT5Q11128 374 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A30Q5SVS4 291 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 PLSCR3Q9NRY6 295 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CNIH4Q9P003 139 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 COMMD3Q9UBI1 195 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SERGEFQ9UGK8 458 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A4O14863 429 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 KAT7O95251 611 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.55■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa17.55■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 TEX47Q8TBZ9 253 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM163Q8TC26 289 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf40AQ8TE69 158 aa17.55■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD54Q6NXT1 300 aa17.55■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CH25HO95992 272 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SUSD6Q92537 303 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 UFD1Q92890 307 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf58Q96GQ5 468 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 STK25O00506 426 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 MAN2A2P49641 1150 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R41P59536 307 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK1G2P78368 415 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK10Q15131 360 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A6Q92536 515 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM246Q9BRR3 403 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A6YYD5 115 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM170BA6NMN3 283 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G10O15496 165 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 RPN2P04844 631 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 APEX1P27695 318 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 NTSP30990 170 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DL3P43628 341 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 QSOX2Q6ZRP7 698 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00471Q8N535 108 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 NDEL1Q9GZM8 345 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0B4J293 547 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa17.53■□□□□ 0.4
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