RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410678.1

RNU6-402P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 402, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-402P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-402P-201ENST00000410678 LRP4O75096 1905 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 THSD7BQ9C0I4 1608 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF263O14978 683 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 AKR7A3O95154 331 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRPS1P60891 318 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 PTGISQ16647 500 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 KLHL35Q6PF15 583 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 TMEM252Q8N6L7 170 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 LRRC52Q8N7C0 313 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 USP6NLQ92738 828 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 PNPLA2Q96AD5 504 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 BIRC7Q96CA5 298 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 HAVCR1Q96D42 359 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 BPIFA2Q96DR5 249 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 RNF145Q96MT1 663 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 TAAR1Q96RJ0 339 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCM2Q9BSQ5 444 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 GDF3Q9NR23 364 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF222Q9UK12 451 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-402P-201ENST00000410678 FRAS1Q86XX4 4008 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 NACADO15069 1562 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 K7ERI5 159 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF264O43296 627 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 TYROBPO43914 113 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CSO75390 466 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CALCAP01258 141 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 EPORP19235 508 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ACKR3P25106 362 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CDH13P55290 713 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 IL10RBQ08334 325 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 PUDPQ08623 228 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ARFRP1Q13795 201 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 PSG5Q15238 335 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CFAP221Q4G0U5 840 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CASC10Q5T4H9 136 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 C1orf228Q6PIY5 440 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPATA8Q6RVD6 105 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRSS48Q7RTY5 328 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 GPR141Q7Z602 305 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 POGLUT1Q8NBL1 392 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 GRK7Q8WTQ7 553 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 OR1E3Q8WZA6 343 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 VPS39Q96JC1 886 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CMTM3Q96MX0 182 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 PDCL3Q9H2J4 239 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 PSD3Q9NYI0 1048 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 COL4A1P02462 1669 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCDC88CQ9P219 2028 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 SDHAF1A6NFY7 115 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ADAMDEC1O15204 470 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 AHCYL1O43865 530 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 KIAA0513O60268 411 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 OR10H3O60404 316 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ANP32DO95626 131 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 OR8U8P0C7N1 319 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 PFKFB1P16118 471 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 UCP1P25874 307 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 HSD17B3P37058 310 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 RGS2P41220 211 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 METAP1P53582 386 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CDH8P55286 799 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CEACAM7Q14002 265 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CRYMQ14894 314 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 AANATQ16613 207 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 DEFB134Q4QY38 66 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 LGSNQ5TDP6 509 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 MEDAGQ5VYS4 303 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 NT5DC3Q86UY8 548 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 SNX32Q86XE0 403 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 NECAP1Q8NC96 275 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 FBXO25Q8TCJ0 367 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 SELENOMQ8WWX9 145 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ST8SIA4Q92187 359 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 ATP6V0A1Q93050 837 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 NXNL1Q96CM4 212 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 FEVQ99581 238 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 CPNE1Q99829 537 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-402P-201ENST00000410678 TM2D1Q9BX74 207 aa-1.05□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms