RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 THSD1Q9NS62 852 aa9.4□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.4□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.4□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 J3QRK9 145 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAM11O75078 769 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PDE9AO76083 593 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 UBXN7O94888 489 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 FHP07954 510 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ST6GAL1P15907 406 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP2R1BP30154 601 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MC3RP41968 323 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 NR1H2P55055 460 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LIM2P55344 173 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGADQ13349 1161 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RUNX2Q13950 521 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OXA1LQ15070 435 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CEBPEQ15744 281 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL14Q8N4G2 192 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF681Q96N22 645 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CSF3RQ99062 836 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DAPP1Q9UN19 280 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM131Q92545 1883 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 THADAQ6YHU6 1953 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 BET1O15155 118 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 NR2F1P10589 423 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 FASLGP48023 281 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DAPP51397 102 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH15P55291 814 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SSTP61278 116 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 S100A12P80511 92 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SPIBQ01892 262 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SYPL1Q16563 259 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DUSP7Q16829 419 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC9A6Q92581 669 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDN23Q96B33 292 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf90Q96M02 699 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF607Q96SK3 696 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 C3orf14Q9HBI5 128 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 EXD2Q9NVH0 621 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MALT1Q9UDY8 824 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.39□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MEN1O00255 615 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFRSF11BO00300 401 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 EMC8O43402 210 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SDC3O75056 442 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 IFNW1P05000 195 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 BCKDHBP21953 392 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CXCL12P48061 93 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RGS19P49795 217 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH12P55289 794 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 NXPH1P58417 271 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ACY1Q03154 408 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LTB4RQ15722 352 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MAPK11Q15759 364 aa9.38□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MANEAQ5SRI9 462 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms