RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 C12orf66Q96MD2 445 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 OR7D2Q96RA2 312 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 NEK6Q9HC98 313 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 ABCB9Q9NP78 766 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 MID1O15344 667 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 SH3BP5O60239 455 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 ACP5P13686 325 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 NTSP30990 170 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 GPC1P35052 558 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 FABP5Q01469 135 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 TSPAN31Q12999 210 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 SLC9A5Q14940 896 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 KLHL22Q53GT1 634 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 TMEM107Q6UX40 140 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 VRK2Q86Y07 508 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 OR8H2Q8N162 312 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 SUSD6Q92537 303 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 C10orf90Q96M02 699 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 TIMM29Q9BSF4 260 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SOS1-201ENST00000395038 COL4A2P08572 1712 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 NUMA1Q14980 2115 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 A0A0B4J293 547 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 PROM1O43490 865 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 FRS3O43559 492 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 APOL3O95236 402 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 APOA1P02647 267 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 CEACAM5P06731 702 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 FHP07954 510 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 GAAP10253 952 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 CERS1P27544 350 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SSTR4P31391 388 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 AHRP35869 848 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 CHRNEQ04844 493 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 MXD1Q05195 221 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 MAP4K2Q12851 820 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SNAPC1Q16533 368 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 9.5
SOS1-201ENST00000395038 ZNF425Q6IV72 752 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 OR2L5Q8NG80 312 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 OR2L3Q8NG85 312 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SMARCD2Q92925 531 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 TMEM203Q969S6 136 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 MOAP1Q96BY2 351 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 RNF31Q96EP0 1072 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 BBS4Q96RK4 519 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 CNIH4Q9P003 139 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.9□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SHISA3A0PJX4 238 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 J3QRE1 110 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 RGS5O15539 181 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 CCNKO75909 580 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SERPIND1P05546 499 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SDC2P34741 201 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 DDOSTP39656 456 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SLC9A3P48764 834 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 PRKAG1P54619 331 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 ERVK-21P61565 698 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 TMEM240Q5SV17 173 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 ZNF544Q6NX49 715 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 XKRXQ6PP77 449 aa5.89□□□□□ -1.47
SOS1-201ENST00000395038 HSDL2Q6YN16 418 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms