RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 SLC39A13Q96H72 371 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC120Q96HB5 630 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FBXL20Q96IG2 436 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 A0A1B0GVC2 190 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GCH1P30793 250 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GNRHRP30968 328 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 S100A10P60903 97 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DMWDQ09019 674 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NENFQ9UMX5 172 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0U1RQS6 177 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GSTT2P0CG29 244 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ABOP16442 354 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 UGT2B10P36537 528 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NKX3-2P78367 333 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LEG1Q6P5S2 330 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GAREM2Q75VX8 874 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NRMQ8IXM6 262 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 OR4K13Q8NH42 304 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LRR1Q96L50 414 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF69Q9UC07 566 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 VDAC3Q9Y277 283 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LRRN3E7EW58 273 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 E2F3O00716 465 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FGF4P08620 206 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GDF1P27539 372 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CRABP1P29762 137 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FASLGP48023 281 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FXYD6P3P58550 94 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF404Q494X3 552 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SPTSSAQ969W0 71 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 STARD5Q9NSY2 213 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CUTCQ9NTM9 273 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 A6NIZ1 184 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 EFCAB7A8K855 629 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 AURKAO14965 403 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CACNG3O60359 315 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PLATP00750 562 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 EDN1P05305 212 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PVRP15151 417 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RAP1BP61224 184 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RAP1AP62834 184 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MYRFLQ96LU7 910 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BPNT1O95861 308 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RPE65Q16518 533 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DEFB123Q8N688 67 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FRS2Q8WU20 508 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms