RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291386.3

SSU72-201, Transcript of SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSU72, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72-201ENST00000291386 ANKRD33BA6NCL7 494 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 NKX2-2O95096 273 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 P04436 131 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 CCL3P10147 92 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 PRIM2P49643 509 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 DGKQP52824 942 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 FBXW4P57775 412 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 RPP38P78345 283 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 VPS26BQ4G0F5 336 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 TMEM81Q6P7N7 255 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 SPPL2AQ8TCT8 520 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 HGDQ93099 445 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 TMBIM1Q969X1 311 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 FRMD6Q96NE9 622 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 Q9N2J8 555 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 DEPPQ9NTK1 212 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 GIN1Q9NXP7 522 aa24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 A0A0G2JND7 137 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 FAM234BA2RU67 622 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR6C70A6NIJ9 312 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 C9JVG2 144 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 TSPAN2O60636 221 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 ABCB7O75027 752 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 MEOX1P50221 254 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 PNLIPRP2P54317 469 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 GAB1Q13480 694 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 BHLHB9Q6PI77 547 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 ANKRD46Q86W74 232 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 FAM13CQ8NE31 585 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR4A15Q8NGL6 344 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR9I1Q8NGQ6 314 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR52E6Q96RD3 313 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 FAM173AQ9BQD7 235 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 EQTNQ9NQ60 294 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 CBLCQ9ULV8 474 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR10H1Q9Y4A9 318 aa24.73■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 SOX30O94993 753 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 PLA2G2AP14555 144 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 FOXK1P85037 733 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 SQLEQ14534 574 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 SPDYE7PQ495Y7 208 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 TBCELQ5QJ74 424 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 SZRD1Q7Z422 152 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR2M7Q8NG81 312 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 NTNG2Q96CW9 530 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 RILPQ96NA2 401 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 COL21A1Q96P44 957 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 PROK2Q9HC23 129 aa24.72■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 REM1O75628 298 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 ACP2P11117 423 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 UQCRC2P22695 453 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 PMP22Q01453 160 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 EFR3AQ14156 821 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 CDC73Q6P1J9 531 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 NR4A3Q92570 626 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 DIO2Q92813 273 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 C16orf58Q96GQ5 468 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 STACQ99469 402 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 ACTRT3Q9BYD9 372 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 ZNF385DQ9H6B1 395 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 OLAHQ9NV23 265 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SSU72-201ENST00000291386 UGT2B11O75310 529 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 KRT16P08779 473 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 GABRA3P34903 492 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 KRT20P35900 424 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 PIGAP37287 484 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 ARFIP2P53365 341 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 GPR85P60893 370 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 TP53BP2Q13625 1128 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 GK5Q6ZS86 529 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 FUNDC1Q8IVP5 155 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 SLC16A11Q8NCK7 471 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 OR5M3Q8NGP4 307 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 ANGPTL4Q9BY76 406 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 DUSP22Q9NRW4 184 aa24.7■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 ALOX5P09917 674 aa24.69■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 SOAT1P35610 550 aa24.69■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 CASP3P42574 277 aa24.69■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SSU72-201ENST00000291386 RCAN2Q14206 197 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms