RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 DAB2P98082 770 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ACSM2AQ08AH3 577 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TAB1Q15750 504 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ZIC1Q15915 447 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ACSM2BQ68CK6 577 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD9Q8NBP5 474 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TTLQ8NG68 377 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 UBASH3BQ8TF42 649 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CHTF18Q8WVB6 975 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 OR52E6Q96RD3 313 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 EBPLQ9BY08 206 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa19.11■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 MYO1GB0I1T2 1018 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA12O60330 932 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 UGT2B17O75795 530 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SLITRK5O94991 958 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CTRB1P17538 263 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AHRP35869 848 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 GFERP55789 205 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 RAE1P78406 368 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ESCO2Q56NI9 601 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CACHD1Q5VU97 1274 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CTRB2Q6GPI1 263 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 NOXRED1Q6NXP6 359 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO42Q6P3S6 717 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D19Q8N5T2 526 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SETD6Q8TBK2 473 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ZFAND1Q8TCF1 268 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 DEDD2Q8WXF8 326 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 FCGR1BQ92637 280 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 UCK2Q9BZX2 261 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 DIABLOQ9NR28 239 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 COQ3Q9NZJ6 369 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PILRAQ9UKJ1 303 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CACNA1HO95180 2353 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC3AO75596 197 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SERPIND1P05546 499 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ST6GAL1P15907 406 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SDC1P18827 310 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TACR1P25103 407 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 NR0B2Q15466 257 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SPIN4Q56A73 249 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CPZQ66K79 652 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 FAM92BQ6ZTR7 304 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 FAM181AQ8N9Y4 354 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC74AQ96AQ1 378 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 F2RL3Q96RI0 385 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 MACROD1Q9BQ69 325 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA6CQ9H3T2 930 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AMBNQ9NP70 447 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 LNP1A1A4G5 178 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CASC3O15234 703 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 WBP4O75554 376 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 IL6P05231 212 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ACPPP15309 386 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 GPR3P46089 330 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 FAPQ12884 760 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 EFR3AQ14156 821 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 GUSBP11Q6P575 273 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SIGLEC11Q96RL6 698 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 MAP3K3Q99759 626 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AICDAQ9GZX7 198 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 POLHQ9Y253 713 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 RGS5O15539 181 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 RETP07949 1114 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ZMAT1Q5H9K5 638 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 COMMD6Q7Z4G1 85 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 VN1R4Q7Z5H5 301 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 DTX3Q8N9I9 347 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TGM7Q96PF1 710 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 ASXL3Q9C0F0 2248 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFS4O43181 175 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 AKR7A2O43488 359 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 B3GALT4O96024 378 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 PSKH1P11801 424 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 NAGAP17050 411 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK1P28482 360 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TNFSF8P32971 234 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 RPS5P46782 204 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 HYAL2Q12891 473 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2B-201ENST00000265339 TP53BP2Q13625 1128 aa19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms