RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 CSNK1DP48730 415 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ATP4BP51164 291 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KDELC1Q6UW63 502 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ARRDC3Q96B67 414 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ACSL6Q9UKU0 697 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DCNP07585 359 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 H2BFMP0C1H6 154 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FAM189BP81408 668 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KCNAB2Q13303 367 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SEC23BQ15437 767 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MTFR2Q6P444 385 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TCEANCQ8N8B7 351 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ULBP3Q9BZM4 244 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TTLL8A6PVC2 850 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GRHL2Q6ISB3 625 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ENPP6Q6UWR7 440 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PIANPQ8IYJ0 282 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SGTBQ96EQ0 304 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 C7orf34Q96L11 122 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NANOGQ9H9S0 305 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TBX21Q9UL17 535 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 EFCAB7A8K855 629 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SDHDO14521 159 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PROM1O43490 865 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PRKACAP17612 351 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CCDC58Q4VC31 144 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CYS1Q717R9 158 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZUFSPQ96AP4 578 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RDH12Q96NR8 316 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KCNK12Q9HB15 430 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 POT1Q9NUX5 634 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FAIMQ9NVQ4 179 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OBP2AQ9NY56 170 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 C5AR2Q9P296 337 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 C4AP0C0L4 1744 aa13.08□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 H0YAE9 185 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ATG9BQ674R7 924 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 SSX6Q7RTT6 188 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 SAMD12Q8N8I0 201 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 OR7G3Q8NG95 312 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ZNF675Q8TD23 568 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 NINJ1Q92982 152 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 CHFRQ96EP1 664 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ARL6Q9H0F7 186 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 WASF3Q9UPY6 502 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 YKT6O15498 198 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 FAM189A1O60320 539 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 MAP2K4P45985 399 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 PIGFQ07326 219 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 GINS1Q14691 196 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 DUSP6Q16828 381 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ALG10Q5BKT4 473 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 KIF18BQ86Y91 864 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 MFSD8Q8NHS3 518 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 LGALS12Q96DT0 336 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 HS6ST2Q96MM7 605 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 TTTY10Q9BZA0 68 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 KCMF1Q9P0J7 381 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 RABL2BQ9UNT1 228 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 NUP98P52948 1817 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 CACNG3O60359 315 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 DNAJB5O75953 348 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 SFTPDP35247 375 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ST3GAL4Q11206 333 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 STEAP4Q687X5 459 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.08□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 FTMTQ8N4E7 242 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms