RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258770.7

TBRG4-201, Transcript of transforming growth factor beta regulator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBRG4, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4-201ENST00000258770 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 CDC73Q6P1J9 531 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 C11orf74Q86VG3 221 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 VRK2Q86Y07 508 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 ZNF566Q969W8 418 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 SCN3BQ9NY72 215 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 CALML5Q9NZT1 146 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 MKLN1Q9UL63 735 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 RNF6Q9Y252 685 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.71□□□□□ -0.05
TBRG4-201ENST00000258770 OR10H3O60404 316 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 UGT2B17O75795 530 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 CPNE6O95741 557 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 TTKP33981 857 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 NUP107P57740 925 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ISOC1Q96CN7 298 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PINK1Q9BXM7 581 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 FAM20BO75063 409 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ATP1B1P05026 303 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 POU1F1P28069 291 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SEPHS1P49903 392 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 RAB38P57729 211 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SMIM11AP58511 58 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 LSAMPQ13449 338 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 NPTX1Q15818 432 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 DUSP5Q16690 384 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PROX2Q3B8N5 592 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SAP25Q8TEE9 199 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PSD2Q9BQI7 771 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PRR14Q9BWN1 585 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 LHPPQ9H008 270 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.7□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 FRS3O43559 492 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 DUX1O43812 170 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 CD1CP29017 333 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 KRT20P35900 424 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 CXCR4P61073 352 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 APH1BQ8WW43 257 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 DGCR6LQ9BY27 220 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PDE7BQ9NP56 450 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 FAAHO00519 579 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 FOXS1O43638 330 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 AGR2O95994 175 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 ACP2P11117 423 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 NR1D2Q14995 579 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 LPAL2Q16609 132 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 CCNJQ5T5M9 372 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 FHL5Q5TD97 284 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 P3H2Q8IVL5 708 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 GAREM1Q9H706 876 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.68□□□□□ -0.06
TBRG4-201ENST00000258770 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms