RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MYL12BO14950 172 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RAPSNQ13702 412 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 APOFQ13790 326 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RAB39AQ14964 217 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ALG11Q2TAA5 492 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC5A8Q8N695 610 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PJA1Q8NG27 643 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR52L1Q8NGH7 329 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PHF21AQ96BD5 680 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AMDHD1Q96NU7 426 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NTN4Q9HB63 628 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 EFCAB10A6NFE3 127 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SOX30O94993 753 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PER3P56645 1201 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ST3GAL3Q11203 375 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF691Q5VV52 312 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SAXO2Q658L1 398 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TAMM41Q96BW9 452 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TGM7Q96PF1 710 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C1GALT1Q9NS00 363 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF639Q9UID6 485 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC16A6O15403 523 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MBTPS2O43462 519 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TPST2O60704 377 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF21O75509 655 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KRT33AO76009 404 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CAPNS1P04632 268 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ERGP11308 486 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NKG7Q16617 165 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 IQCCQ4KMZ1 466 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM156Q8N614 296 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF354BQ96LW1 612 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 THSD1Q9NS62 852 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 IRGMA1A4Y4 181 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ANTXRLA6NF34 631 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ADAP00813 363 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEA2P43356 314 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 COPZ1P61923 177 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CDK5R2Q13319 367 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NCF4Q15080 339 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ISOC1Q96CN7 298 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FANCFQ9NPI8 374 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 EYSQ5T1H1 3165 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 XPNPEP2O43895 674 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRSS23O95084 383 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 BMP7P18075 431 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MC3RP41968 323 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 E2F2Q14209 437 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM64Q6YI46 380 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MMP21Q8N119 569 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL31Q9H511 634 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TLR4O00206 839 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CER1O95813 267 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CD38P28907 300 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SOX6P35712 828 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DAPP51397 102 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CXCR4P61073 352 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ID2Q02363 134 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RUNX1T1Q06455 604 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GPR68Q15743 365 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SNAPC1Q16533 368 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PROX2Q3B8N5 592 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CRHBPP24387 322 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ITPKBP27987 946 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMBIM6P55061 237 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF17Q02223 184 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms