RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.56□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 NLKQ9UBE8 527 aa6.56□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 DUSP13Q9UII6 198 aa6.56□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 KCNK6Q9Y257 313 aa6.56□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.56□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ELK4P28324 431 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 RRN3P1Q2M238 152 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MKXQ8IYA7 352 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PCED1BQ96HM7 432 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SUSD3Q96L08 255 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PWWP2AQ96N64 755 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 GABRA3P34903 492 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP2CAP67775 309 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 Q6ZVU0 165 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 OBP2AQ9NY56 170 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF69Q9UC07 566 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 WDR45Q9Y484 360 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ENTPD6O75354 484 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TGFB1P01137 390 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 RARRES1P49788 294 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PRELID1Q9Y255 219 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 AQP9O43315 295 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PRSS56P0CW18 603 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 CRABP1P29762 137 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 XKP51811 444 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 NEDD8Q15843 81 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MTX3Q5HYI7 312 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 OR10A6Q8NH74 314 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 C1orf226A1L170 272 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 B4DXG7 233 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 YIF1AO95070 293 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 GPIP06744 558 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SERPINE2P07093 398 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MAP2K3P46734 347 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 EFNA3P52797 238 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SIRPAP78324 504 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TAZQ16635 292 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 IFI44LQ53G44 452 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PLET1Q6UQ28 207 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TUBA4BQ9H853 241 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 C1orf109Q9NX04 203 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 A0A087WXM4 84 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ACTC1P68032 377 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ACTA1P68133 377 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 NKX3-2P78367 333 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TSSK3Q96PN8 268 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PMM2O15305 246 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 NR1H2P55055 460 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ST3GAL1Q11201 340 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 ASB9Q96DX5 294 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 DEPDC5O75140 1603 aa6.55□□□□□ -1.36
NDUFS1-201ENST00000233190 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms