RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 LIPAP38571 399 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 VBP1P61758 197 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SHC2P98077 582 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ST3GAL4Q11206 333 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 DUSP5Q16690 384 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 FHL5Q5TD97 284 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 IQCHQ86VS3 1027 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 OOSP2Q86WS3 158 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 IL4I1Q96RQ9 567 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CALML5Q9NZT1 146 aa11.71□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 KRBA1A5PL33 1030 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 DUXAA6NLW8 204 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CLPXO76031 633 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 WNT1P04628 370 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ACP2P11117 423 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CD36P16671 472 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 HOXC5Q00444 222 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SYT16Q17RD7 645 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 INAVAQ3KP66 663 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 C12orf73Q69YU5 71 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CA13Q8N1Q1 262 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 STX19Q8N4C7 294 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ITPAQ9BY32 194 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 POMT2Q9UKY4 750 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CLDN24A6NM45 220 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SGK494L7N484 410 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 MPZL2O60487 215 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ENTPD6O75354 484 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PTHP01270 115 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TNNI3P19429 210 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TGFBR1P36897 503 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 NCS1P62166 190 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 FZD5Q13467 585 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 IRF3Q14653 427 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 MOGQ16653 247 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 MANEAQ5SRI9 462 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 FCGR1BQ92637 280 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CLN6Q9NWW5 311 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.7□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 A0A087WUU8 490 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SH3D21A4FU49 640 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SLC22A1O15245 554 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ADORA3P0DMS8 318 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PRKAR1BP31321 381 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 AVPR1BP47901 424 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 BLKP51451 505 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 BMXP51813 675 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TAS2R41P59536 307 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CCNJQ5T5M9 372 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 DIO2Q92813 273 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SLC38A4Q969I6 547 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 DMDP11532 3685 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 RDH16O75452 317 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CYP7B1O75881 506 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 GPR75O95800 540 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ATP1B1P05026 303 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CT62P0C5K7 136 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 NUDT1P36639 197 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 SLC15A1P46059 708 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 TIGD6Q17RP2 521 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.69□□□□□ -0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms