RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 BNIP3Q12983 259 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 TSSK4Q6SA08 328 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 ISOC1Q96CN7 298 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 SDF2Q99470 211 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE7BQ9NP56 450 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR45Q9Y484 360 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM20BO75063 409 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SEC14L2O76054 403 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ALOX5P09917 674 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PCMT1P22061 227 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PCSK6P29122 969 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MAPK10P53779 464 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 OR1D5P58170 312 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 LSAMPQ13449 338 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PEX11GQ96HA9 241 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CD180Q99467 661 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 IER2Q9BTL4 223 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 UCK2Q9BZX2 261 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 LHPPQ9H008 270 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 KLHL3Q9UH77 587 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 TGFBR3LH3BV60 316 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 FRS3O43559 492 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 TPST2O60704 377 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CHMP24386 653 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 DCKP27707 260 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K8P41279 467 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CRISP1P54107 249 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 INAVAQ3KP66 663 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CCNJQ5T5M9 372 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR107Q5VW38 600 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MPP4Q96JB8 637 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 STACQ99469 402 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PRR14Q9BWN1 585 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 DUSP22Q9NRW4 184 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 IFT52Q9Y366 437 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZAR1LA6NP61 321 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 OR10H2O60403 315 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CBX7O95931 251 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 GIMD1P0DJR0 217 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 GABRB1P18505 474 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CTSKP43235 329 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 UGT2B15P54855 530 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SYT16Q17RD7 645 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 TCTE1Q5JU00 501 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC103Q8IW40 242 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 MUL1Q969V5 352 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SATB2Q9UPW6 733 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 USP34Q70CQ2 3546 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 FITM1A5D6W6 292 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 HRO43593 1189 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CTNSO60931 367 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-201ENST00000216840 OSMP13725 252 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms