RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rae1Q8C570 368 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrp11Q8CB67 483 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nfatc4Q8K120 901 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr935Q8VG16 308 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam118aQ91YN1 357 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CenpvQ9CXS4 252 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lypd6bQ9D7F2 191 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NaaaQ9D7V9 362 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdc20Q9JJ66 499 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrk1Q3UHC2 2014 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plce1Q8K4S1 2282 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smim17A0A504 109 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp362B1ASA5 418 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp599E9PWP1 548 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Srp54bE9PXC0 504 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1121L7MTT1 314 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdk5r2O35926 369 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zw10O54692 779 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sod2P09671 222 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fabp3P11404 133 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcp2P12660 120 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bmp1P98063 991 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dmrtc1bQ2PMX6 267 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trappc13Q3TIR1 417 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Brf2Q3UAW9 420 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr20Q3UWE6 569 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp280bQ505F4 534 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q5SPV6 233 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttf1Q62187 859 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BC024139Q8BVJ3 772 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr37Q8CBE3 496 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grhl2Q8K5C0 625 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mterf3Q8R3J4 412 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vsx1Q91V10 363 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cmpk1Q9DBP5 196 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgf21Q9JJN1 210 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dmrt1Q9QZ59 374 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfap5Q9QZJ6 164 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DmdP11531 3678 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CN725425A0A087WRU1 652 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm14862B1AV28 81 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcpp2E9PYC2 171 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp97E9PZP6 546 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8237E9Q257 205 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3636E9Q5P1 227 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcpp1L7N1X9 171 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp960L7N267 546 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fpr-s1O08790 351 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PlgP20918 812 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bmp4P21275 408 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IduaP48441 634 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc16a3P57787 470 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam20cQ5MJS3 579 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CfiQ61129 603 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Avl9Q80U56 649 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfn2Q80U63 757 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vac14Q80WQ2 782 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q810M1 233 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lgi4Q8K1S1 537 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TapbplQ8VD31 451 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd10Q99LW0 415 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wwp2Q9DBH0 870 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lypd2Q9DD23 127 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rai1Q61818 1889 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A1L1STL9 112 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr605E9Q838 314 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dll3O88516 592 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AboP38649 332 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cxcl12P40224 93 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptpn2Q06180 406 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc47a2Q3V050 573 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nr2f1Q60632 422 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lasp1Q61792 263 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prg2Q61878 223 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Awat2Q6E1M8 333 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1275Q7TQY8 312 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcmf1Q80UY2 381 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mettl20Q80ZM3 255 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SheQ8BSD5 492 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klhl31Q8BWA5 634 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PxkQ8BX57 582 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam46bQ8C152 427 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bloc1s5Q8R015 185 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr985Q8VGB4 311 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uck2Q99PM9 261 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ergic3Q9CQE7 383 aa9.62□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.3 ms