RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taar2Q5QD17 339 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ugt8Q64676 541 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tm7sf2Q71KT5 418 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp184Q7TSH9 737 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC024139Q8BVJ3 772 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r219Q8R271 312 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr44Q9EQB8 314 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thbs4Q9Z1T2 963 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cacna1dQ99246 2179 aa16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r9A2RST7 299 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc27a6E9Q9W4 619 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn4O35054 210 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk1P11440 297 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PgfP49764 158 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cct3P80318 545 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taf1aP97357 453 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CrtamQ149L7 389 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Meig1Q61845 88 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Szrd1Q6NXN1 152 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a24Q8BMD8 475 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Akr1d1Q8VCX1 325 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr170Q8VGL6 313 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr938Q9EQ93 315 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r10W4VSP8 311 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm14744B1AVU4 173 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm20547B8JJN0 1276 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RngttO55236 597 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CfbP04186 761 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rad52P43352 420 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hif3aQ0VBL6 662 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acss3Q14DH7 682 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rspo3Q2TJ95 277 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp280bQ505F4 534 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Morn4Q6PGF2 146 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc22a22Q8R0S9 554 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ogfrl1Q8VE52 464 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc3a1Q91WV7 685 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pbld1Q9DCG6 288 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sars2Q9JJL8 518 aa16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr396-ps1A0A0U1RNF5 211 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtnd2P03893 345 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxc5P32043 222 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp6v1e1P50518 226 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CpeQ00493 476 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Entpd7Q3TCT4 606 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp974Q3UVF6 752 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spin1Q61142 262 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5416Q6IE28 97 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PianpQ6P1B3 278 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap4e1Q80V94 1122 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chrnb3Q8BMN3 464 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PpcdcQ8BZB2 204 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgif2Q8C0Y1 237 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem163Q8C996 288 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1387Q8VFA9 311 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr700Q8VFM5 316 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem168Q91VX9 697 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam174aQ9D3L0 190 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Orc6Q9WUJ8 262 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PcntP48725 2898 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adam3F8VQ03 822 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r27K7N688 303 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TP20293 436 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cers1P27545 350 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nell1Q2VWQ2 810 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C8bQ8BH35 589 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem268Q8R239 342 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zdhhc5Q8VDZ4 715 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiss1rQ91V45 396 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcbld2Q91ZV3 769 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Timm22Q9CQ85 194 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actl11Q9D5V1 1207 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MsraQ9D6Y7 233 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlr4Q9QUK6 835 aa16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700023F06RikA2AB62 382 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2956E9PVJ0 216 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5796E9Q7M8 205 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3629K7N6Y2 205 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10340K7N708 205 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8108K7N734 216 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r95L7N274 845 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phox2bO35690 314 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk5P49615 292 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgf1P61148 155 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spag8Q3V0Q6 470 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il10raQ61727 575 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ThrspQ62264 150 aa16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tpgs2Q66JT5 296 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.5 ms