RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635519.1

NRXN1-242, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-242ENST00000635519 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 G3V3Q6 166 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 YIF1AO95070 293 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 MT-ND1P03886 318 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SOD2P04179 222 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 THBS1P07996 1170 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SYPP08247 313 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 NFYBP25208 207 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ARL4AP40617 200 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 EPHB3P54753 998 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CLDN20P56880 219 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 FOXM1Q08050 763 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TSPAN31Q12999 210 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 OPCMLQ14982 345 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 RSU1Q15404 277 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ISXQ2M1V0 245 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 PYCR3Q53H96 274 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 EXTL1Q92935 676 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CHST5Q9GZS9 411 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 RNF39Q9H2S5 420 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 FZD3Q9NPG1 666 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 INSL6Q9Y581 213 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 NFASCO94856 1347 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 H3BRB1 525 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 H7C4K7 107 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CCSO14618 274 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TOXO94900 526 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 FGBP02675 491 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 PPBPP02775 128 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CYC1P08574 325 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 HOXC8P31273 242 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 NPBWR1P48145 328 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ARSEP51690 589 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SYTL3Q4VX76 610 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 EPGNQ6UW88 154 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 KCTD9Q7L273 389 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 LAX1Q8IWV1 398 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CDS1Q92903 461 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 RAB3CQ96E17 227 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 RAB20Q9NX57 234 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 PAK5Q9P286 719 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.39□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 DHRS12A0PJE2 317 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 WASH4PA8MWX3 477 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 M0QYT0 321 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TP53I11O14683 189 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 CHADO15335 359 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 PAPLNO95428 1278 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ETS1P14921 441 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 LHCGRP22888 699 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 DNASE1P24855 282 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 GCLMP48507 274 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM198Q66K66 360 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 OR52W1Q6IF63 320 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 DPPA4Q7L190 304 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF614Q8N883 585 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 NUBPLQ8TB37 319 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 APIPQ96GX9 242 aa5.38□□□□□ -1.55
NRXN1-242ENST00000635519 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms