RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF843	Q8N446	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	C12orf29	Q8N999	325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF383	Q8NA42	475 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	BBS2	Q9BXC9	721 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SDCBP2	Q9H190	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	P2RY12	Q9H244	342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CUEDC2	Q9H467	287 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	C5orf51	A6NDU8	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931		H0YIG0	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SERPINF2	P08697	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CD59	P13987	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	LHCGR	P22888	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ADORA2B	P29275	332 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SFTPD	P35247	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAP3K7CL	P57077	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAPK11	Q15759	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNST	Q6PJW8	725 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ISCA2	Q86U28	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TSSK2	Q96PF2	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM237	Q96Q45	408 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RNF121	Q9H920	327 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	APPL1	Q9UKG1	709 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NUMA1	Q14980	2115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP8B3	O60423	1300 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PTPRB	P23467	1997 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPEG	Q15772	3267 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYCE3	A1L190	88 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931		O00370	1275 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	INSIG1	O15503	277 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	HMBS	P08397	361 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	F3	P13726	295 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	LIF	P15018	202 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CA6	P23280	308 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NDST1	P52848	882 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	OPCML	Q14982	345 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF699	Q32M78	642 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CACUL1	Q86Y37	369 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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