RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OXSMQ9NWU1 459 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SIRT5Q9NXA8 310 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EHD3Q9NZN3 535 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SOX18P35713 384 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CASP3P42574 277 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 KIR3DL1P43629 444 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PPICP45877 212 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRPC1P48995 793 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SLC18A2Q05940 514 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF763Q0D2J5 394 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF628Q5EBL2 1059 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf185Q5T7R7 199 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OR9A2Q8NGT5 310 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ERP27Q96DN0 273 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OMA1Q96E52 524 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 BBS4Q96RK4 519 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 METTL7AQ9H8H3 244 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FRG2CA6NGY1 282 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRAPPC6AO75865 159 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 UROSP10746 265 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GABRA1P14867 456 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DDCP20711 480 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DRD5P21918 477 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EMDP50402 254 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SLC18A1P54219 525 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GNGT1P63211 74 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C2orf80Q0P641 193 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LIPMQ5VYY2 423 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NUP54Q7Z3B4 507 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM46Q7Z4K8 759 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRABD2AQ86V40 505 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FAM9CQ8IZT9 166 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 KAT2AQ92830 837 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HGDQ93099 445 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM41AQ96HV5 264 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TTYH2Q9BSA4 534 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MYNNQ9NPC7 610 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EXPH5Q8NEV8 1989 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TO15178 435 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GLI4P10075 376 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MPIP34949 423 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CEBPEQ15744 281 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FNDC7Q5VTL7 733 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TIGD3Q6B0B8 471 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RTL6Q6ICC9 239 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SLC30A6Q6NXT4 461 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM81Q6P7N7 255 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 BTBD9Q96Q07 612 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NODALQ96S42 347 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRMOQ9BU70 441 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 UBQLN3Q9H347 655 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ANKRA2Q9H9E1 313 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MKS1Q9NXB0 559 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NCKAP5O14513 1909 aa13.21□□□□□ -0.3
CMTM3-215ENST00000568477 POLQO75417 2590 aa13.21□□□□□ -0.3
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-215ENST00000568477 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-215ENST00000568477 PRAMEF25A6NGN4 478 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-215ENST00000568477 ENO4A6NNW6 628 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-215ENST00000568477 GNB5O14775 395 aa13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms