RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNX21	Q969T3	373 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LHX3	Q9UBR4	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FRG2C	A6NGY1	282 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC69	A6NI79	296 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDLIM1	O00151	329 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HDAC3	O15379	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GNS	P15586	552 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGEA4	P43358	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PITPNB	P48739	271 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	BNIPL	Q7Z465	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2L5	Q8NG80	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NYAP2	Q9P242	653 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTRR	Q9UBK8	725 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTPRU	Q92729	1446 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRIT2	A6NDA9	550 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSC22D2	O75157	780 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGSF6	O95976	241 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HMOX1	P09601	288 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HLA-DPA1	P20036	260 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTPN4	P29074	926 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIM23	P36406	574 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NT5C2	P49902	561 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC26A2	P50443	739 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAG2	P55895	527 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAMK4	Q16566	473 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	EPC2	Q52LR7	807 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	OLFM4	Q6UX06	510 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM45B	Q96B21	275 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	VPS39	Q96JC1	886 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYCE3	A1L190	88 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TLR4	O00206	839 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHG3	P01860	377 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHRNA3	P32297	505 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HAND2	P61296	217 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HERVK_113	P63132	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVK-8	P63133	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PUDP	Q08623	228 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PARP6	Q2NL67	630 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT35	Q92764	455 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	P3H4	Q92791	437 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TADA1	Q96BN2	335 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NLN	Q9BYT8	704 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC17A2	O00624	439 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
PAPOLA-222	ENST00000556787	SERF1A	O75920	110 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC2A10	O95528	541 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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