RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 PLCXD2Q0VAA5 305 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 LCP2Q13094 533 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SNTA1Q13424 505 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 HEPACAMQ14CZ8 416 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SPIN4Q56A73 249 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 DCST1Q5T197 706 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ARSKQ6UWY0 536 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 SH2D5Q6ZV89 423 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 RHOXF2Q9BQY4 288 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 GALNT9Q9HCQ5 603 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 PFDN4Q9NQP4 134 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 EHD3Q9NZN3 535 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TBK1Q9UHD2 729 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-229ENST00000551936 TACC2O95359 2948 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CT45A8P0DMV1 189 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CT45A9P0DMV2 189 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 NAGLUP54802 743 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 BTKQ06187 659 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ACSM2AQ08AH3 577 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MYBPHQ13203 477 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TOMM20Q15388 145 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CT45A2Q5DJT8 189 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 LACC1Q8IV20 430 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CNPY4Q8N129 248 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 WDSUB1Q8N9V3 476 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 OR9A2Q8NGT5 310 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 KAT2AQ92830 837 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ERP27Q96DN0 273 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 BTBD9Q96Q07 612 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CAMK2AQ9UQM7 478 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CCDC151A5D8V7 595 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 OR6C70A6NIJ9 312 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 DVL2O14641 736 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TSPAN2O60636 221 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 NME6O75414 186 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CBR3O75828 277 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 IL2RAP01589 272 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 BMP5P22003 454 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ZNF136P52737 540 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 18.9
CS-229ENST00000551936 ZYG11AQ6WRX3 759 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TMBIM1Q969X1 311 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TMCO6Q96DC7 493 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CCDC126Q96EE4 140 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SLC35A4Q96G79 324 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 COL21A1Q96P44 957 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TRIB1Q96RU8 372 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SH3GL2Q99962 352 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 EBPLQ9BY08 206 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CALHM2Q9HA72 323 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 KLRF1Q9NZS2 232 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MAPRE3Q9UPY8 281 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 PRAMEF25A6NGN4 478 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CD8B2A6NJW9 211 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MYO1GB0I1T2 1018 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 PLOD3O60568 738 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 GLRA3O75311 464 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 REM1O75628 298 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ACTL6AO96019 429 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 PROCP04070 461 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SHBGP04278 402 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MYL2P10916 166 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MPIP34949 423 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 GSTM5P46439 218 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 CORO7P57737 925 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 C2orf80Q0P641 193 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 NPSR1Q6W5P4 371 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 LRRN4CLQ8ND94 238 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 OR7G2Q8NG99 324 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-229ENST00000551936 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms