RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519552.1

DCTN4-208, Transcript of dynactin subunit 4, human

TSL 4

Gene DCTN4, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN4-208	ENST00000519552	FZR1	Q9UM11	496 aa		5	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552		A0A0J9YVX5	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	PDLIM1	O00151	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SDC3	O75056	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	GSTA1	P08263	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	GHR	P10912	638 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552		A0A087WWV3	80 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552		E9PAM4	449 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	IMPA2	O14732	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	KBTBD11	O94819	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	NDUFA7	O95182	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	DNAJB1	P25685	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	PTPN6	P29350	595 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	GMFB	P60983	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	CRMP1	Q14194	572 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	NCLN	Q969V3	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	NUDT14	O95848	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	IGSF6	O95976	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	HOXB7	P09629	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ASMT	P46597	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	TAF6	P49848	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ZP4	Q12836	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	ABCC4	O15439	1325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DCTN4-208	ENST00000519552	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552		H0YL77	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	PDXK	O00764	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	BCL2L11	O43521	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	GPRIN2	O60269	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	BRCC3	P46736	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	IST1	P53990	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	HERVK_113	P63132	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	ERVK-8	P63133	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	SRY	Q05066	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCTN4-208	ENST00000519552	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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