RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM42Q8IWZ5 723 aa27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 OR4F6Q8NGB9 312 aa27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ACSS3Q9H6R3 686 aa27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 BRF2Q9HAW0 419 aa27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 BCAP29Q9UHQ4 241 aa27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 MAPRE3Q9UPY8 281 aa27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 PRAMEF25A6NGN4 478 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 FRG2CA6NGY1 282 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 OR6C70A6NIJ9 312 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 RPS17P08708 135 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 GCKP35557 465 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 HMGCS1Q01581 520 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 FBXW10Q5XX13 1052 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ENPP6Q6UWR7 440 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 OR52R1Q8NGF1 315 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 SLC35A4Q96G79 324 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 YIPF4Q9BSR8 244 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 VPS11Q9H270 941 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 PIGMQ9H3S5 423 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 PRODH2Q9UF12 536 aa27.41■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 FN1P02751 2386 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 A8MXE2 369 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 CHMP24386 653 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 CNTFP26441 200 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 MILR1Q7Z6M3 343 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 RELL1Q8IUW5 271 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF675Q8TD23 568 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 C18orf12Q96KH6 178 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 BTBD9Q96Q07 612 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ACBD3Q9H3P7 528 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ELOVL6Q9H5J4 265 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 NEUROD4Q9HD90 331 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 KLRF1Q9NZS2 232 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 XPR1Q9UBH6 696 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF225Q9UK10 706 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 SLC12A4Q9UP95 1085 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ARID1AO14497 2285 aa27.4■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 SH3D21A4FU49 640 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 HCRTR2O43614 444 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 TNFSF13O75888 250 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 SRD5A2P31213 254 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 CLDN18P56856 261 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 GAB1Q13480 694 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 LETMD1Q6P1Q0 360 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 PLCZ1Q86YW0 608 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM151AQ8N4L1 468 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ADCY4Q8NFM4 1077 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 OR14L1PQ8NHC6 308 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 EHD3Q9NZN3 535 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 PSME2Q9UL46 239 aa27.39■■□□□ 1.98
ALYREF-202ENST00000505490 B4DXG7 233 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 H0Y3Z8 333 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 PPP6CO00743 305 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 PDYNP01213 254 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 DRD2P14416 443 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF708P17019 499 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 LTB4RQ15722 352 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF628Q5EBL2 1059 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 SCIMPQ6UWF3 145 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 LUZP2Q86TE4 346 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 IFNEQ86WN2 208 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 KLHL29Q96CT2 875 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 ERP27Q96DN0 273 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 COL21A1Q96P44 957 aa27.38■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 TSPAN2O60636 221 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 ABCB7O75027 752 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 SBK3P0C264 359 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 CT45A8P0DMV1 189 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 CT45A9P0DMV2 189 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 COL6A2P12110 1019 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 PCSK2P16519 638 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 LTBQ06643 244 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 CT45A2Q5DJT8 189 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 PLXDC2Q6UX71 529 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 TMCO6Q96DC7 493 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 SMR3AQ99954 134 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 TAS2R10Q9NYW0 307 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 NINJ2Q9NZG7 142 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 FBXL2Q9UKC9 423 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 TESMINQ9Y4I5 508 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-202ENST00000505490 WIF1Q9Y5W5 379 aa27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms