RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HSD3B2P26439 372 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ACVR2AP27037 513 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KRT6CP48668 564 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 BTN3A2P78410 334 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PHEXP78562 749 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HMGCS1Q01581 520 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 IFT88Q13099 833 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 STX3Q13277 289 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NSDHLQ15738 373 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 EXT1Q16394 746 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 Q6ZSR9 355 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CA13Q8N1Q1 262 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 METTL4Q8N3J2 472 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SLC5A8Q8N695 610 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR2T11Q8NH01 316 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01560Q8TB33 94 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PIGTQ969N2 578 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 APIPQ96GX9 242 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PEX11GQ96HA9 241 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 C3orf30Q96M34 536 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KCNC2Q96PR1 638 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SERINC2Q96SA4 455 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CSF3RQ99062 836 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINI1Q99574 410 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 GSX2Q9BZM3 304 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 MMP25Q9NPA2 562 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 LANCL2Q9NS86 450 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HAO1Q9UJM8 370 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CYR61O00622 381 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PIP5K1BO14986 540 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HS6ST1O60243 411 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PDE9AO76083 593 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HSPA4LO95757 839 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 GBAP04062 536 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PAX1P15863 534 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SOX18P35713 384 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ARFIP1P53367 373 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 MTTPP55157 894 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 LIM2P55344 173 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR4D2P58180 307 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SLC26A5P58743 744 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TAS2R50P59544 299 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OCRLQ01968 901 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RHAGQ02094 409 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA0040Q15053 153 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 XKR7Q5GH72 579 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TSLPQ969D9 159 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 UCN3Q969E3 161 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RGMAQ96B86 450 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 LPAR4Q99677 370 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms